Hva er metabolomet? Kartlegging av kroppens kjemiske signatur

Et metabolomet er en detaljert oversikt over signalestoffer, metabolitter, hormoner og lignende strukturer i en organisme. Noen produseres naturlig, andre gjennom metabolisering av innatt mat og legemidler. I løpet av livet endres en organismes kjemiske sammensetning. Man kan ta et «øyeblikksbilde» for å se hva som finnes og produseres på et gitt tidspunkt, men bildet endres fra øyeblikk til øyeblikk.

Medisinsk relevans

Studiet av menneskets metabolomet er av stor interesse. Medisinsk testing er ofte avhengig av metabolitter for diagnostikk. Lege kan se på tilstedeværelse/fravær av stoffer for å inkludere/ekskludere sykdommer, eller vurdere medisineffekt. I dag er bare en brøkdel identifiserbar med standardtesting. Utvidet metabolitt-dekking ville gi flere muligheter for nøyaktig diagnose og pasientovervåking.

Genetikk og miljø samspiller

Metabolomet gir unik innsikt i samspillet mellom genetikk og miljø. Genomet koder for produksjon av hormoner, enzymer mv. Feil kan gi mangler/defekte stoffer. Miljøet (kosthold, drikke, eksponering) påvirker også metabolomet og skaper andre kjemiske signaturer.

Forskningsmuligheter

Forskere kan studere hvordan miljø påvirker genuttrykk (slår gener av/på), hvordan organismer håndterer miljøendringer, og reaksjoner på giftstoffer. Metabolomet inneholder kjemikalier kroppen bruker for livet: energimolekyler, signalhormoner som utløser fruktbarhet og reproduksjon.

Sekvenseringsutfordringer

En kanadisk gruppe utviklet første grove sekvensering av menneskets metabolomet. Arbeidet er utfordrende: prøver fra ulike kroppsdelar inneholder ulike stoffer, og endres over tid. Leverceller gir annet bilde enn andre vev/væsker. Mange deler er stedsspesifikke. Vellykket kartlegging krever detaljert, grundig prøvetaking.