Hjem >> Kreft >> Derfor QSAR modellene ikke er stand til å generalisere mellom flere Targets

Derfor QSAR modellene ikke er stand til å generalisere mellom flere Targets

Sammen med protein phosphotases, kinaser oppføre seg som regulatoriske brytere for i utgangspunktet alle cellulære prosesser, herunder metabolske veier, cellevekst, differensiering, overlevelse og apoptosis.Abnormal funksjon av protein kinaser fører til utvikling av mange alvorlige sykdommer, slik som for eksempel kreft, diabetes, inflammatoriske og autoimmune tilstander og sykdommer i hjerte. Nærmere bestemt kan en rekke kreftformer være forbundet med økt utøvelse av forskjellige vekstfaktor-reseptor-tyrosin-kinaser på grunn av i forhold til ekspresjon eller mutasjoner som fører til konstitutivt aktiv forms.Great forventning ble plassert at inhibering av dysfunksjonelle kinaser, kan føre til frisk imponerende therapies.Nepicastat 195881 -94 til 8

utgangspunktet små-molekyl kinase inhibitor, imatinib, ble lansert i 2001 som et anticancermiddel for behandling av kronisk myelogen leukemi; dens bevegelse er å inhibere konstitutivt aktiv form av Abelson tyrosinkinase. Siden da ble ni forbindelser rettet mot kinase katalytiske setet er godkjent for behandling av ulike former for kreft; over tretti kinase hemmere er i de kliniske stadier av utviklingen, og ytterligere er i prekliniske rørledninger. Et problem inne fremdriften av kinase inhibitorsis å oppnå spesifisitet. Mange av kinase hemmere i siste utvikling sosialisere med kinaser WI ATP-bindende kløft, hvor de konkurrerer med ATP. Ikke desto mindre, er ATP-bindingssetet sterkt konservert blant alle kinaser og det er således vanskelig å forme et stoff selektiv for bare en kinase samtidig. Andre funksjonelle domener som har blitt brukt til å målrette kinaser er også bevart blant mange kinaser genererer utformingen av spesielle hemmere problematiske også i disse tilfellene.

faktisk en stor-skala verifisering utført av Fabian et al.revealed som flere innledende FDA-godkjent hemmere utgangspunktet samhandlet med om lag en sjettedel av proteiner kinaser inkludert i skjermen; hver av dem hjørne samhandlet med mellom 18-23 av 119 evaluert proteinkinaser. Sytten andre kinase hemmere i pre- og kliniske stadier av utviklingen ble påvist å eie ulike grad av promiskuitet og ble også testet i løpet av denne anmeldelsen; bare en av forbindelsene samhandlet med mindre enn flere kinaser. Mange lovende kinase hemmere ble forlatt tidlig på grunn av forgiftning. Bare en vanlig årsak til feilen var mangel på medisinsk effektivitet. Sistnevnte problem kan tilskrives de mange og kompleksiteten av cellulære signalkaskader, har unødvendige stier og komplekse materetursystemer. Bruk av variable rettede forbindelser som kan selektivt hindre at en viss klasse av kinaser av disse gangveier kan øke muligheten til å oppnå klinisk anti-tumor virkning. Enda en grunn til ikke nok medisinsk nytteverdi er motstanden som vises på grunn av mutasjoner inne i fokus oncogene.PJ34 PARP hemmer

QSAR modeller er vant til å forbedre flere egenskaper og å utføre personlig screening for å finne friske treff og direkte forbindelser for målet oppgave. Likevel ulempene QSAR er at dets modeller vurdere eneste egenskapene av ligander og at det analyserer interaksjoner med bare én farmasøytisk målrettet i et time.Hence QSAR modeller er ikke i stand til å generalisere mellom flere targets.An ekstra standard tilnærming er proteochemometric modellering, som vi introdusert noe tid før en anmeldelse av forskjeller i mekanismene for molekylær identifikasjon for grupper av tilknyttede proteiner. Proteochemometric modeller er ifølge eksperimentelt fastsatte interaksjonsdata for rekke proteiner i samspill med serier av ligander, slik som organiske stoffer, peptid-inhibitorer, substrater, osv.

Denne informasjonen er korrelert til beskrivelsene i de to sett av samvirkende virksomheter, som genererer modeller som kan være riktig brukt for å anslå aktiviteter men utestet ligand proteinkombinasjoner, samt forutse tidsfordriv profiler av boken usett ligander og proteiner.